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Molekulare Epidemiologie (Quelltext anzeigen)

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Die '''molekulare Epidemiologie''' ist der Bereich der [[Epidemiologie]], bei dem Erkenntnisse aus dem molekularen Aufbau von [[Pathogen]]en gewonnen werden, z. B. aus der [[DNA-Sequenz]] oder der [[Aminosäuresequenz]].
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Die '''molekulare Epidemiologie''' ist der Bereich der [[Epidemiologie]], bei dem Erkenntnisse aus dem molekularen Aufbau von [[Wikipedia:Pathogen|Pathogen]]en gewonnen werden, z. B. aus der [[Wikipedia:DNA-Sequenz|DNA-Sequenz]] oder der [[Wikipedia:Aminosäuresequenz|Aminosäuresequenz]].
    
== Eigenschaften ==
 
== Eigenschaften ==
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Die molekulare Epidemiologie verwendet sequenzbasierte Daten oder andere Typisierungsdaten eines oder mehrerer [[Biomarker (Medizin)|Biomarker]] zur Bestätigung oder zum Ausschluss von [[Epidemie]]n,<ref name="PMID 24531166">R. Ranjbar, A. Karami, S. Farshad, G. M. Giammanco, C. Mammina: ''Typing methods used in the molecular epidemiology of microbial pathogens: a how-to guide.'' In: ''The new microbiologica.'' Band 37, Nummer 1, Januar 2014, S.&nbsp;1–15, {{ISSN|1121-7138}}. PMID 24531166.</ref> zur Ermittlung der [[Infektkette|Transmission]] und der [[Infektionsweg]]e, der Verbreitung, der [[Replikation]] und der [[Mutation|Diversität]] von Pathogenen.<ref name="PMID 24631223">N. Field, T. Cohen, M. J. Struelens, D. Palm, B. Cookson, J. R. Glynn, V. Gallo, M. Ramsay, P. Sonnenberg, D. Maccannell, A. Charlett, M. Egger, J. Green, P. Vineis, I. Abubakar: ''Strengthening the Reporting of Molecular Epidemiology for Infectious Diseases (STROME-ID): an extension of the STROBE statement.'' In: ''[[The Lancet Infectious Diseases]].'' Band 14, Nummer 4, April 2014, S.&nbsp;341–352, {{ISSN|1474-4457}}. {{DOI|10.1016/S1473-3099(13)70324-4}}. PMID 24631223.</ref> [[Fehlerquelle]]n der molekularen Epidemiologie sind z. B. eine unvollständige Datenerfassung.<ref>M. Desai, J. Kubo, D. Esserman, M. B. Terry: ''The handling of missing data in molecular epidemiology studies.'' In: ''[[Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention]].'' Band 20, Nummer 8, August 2011, S.&nbsp;1571–1579, {{ISSN|1538-7755}}. {{DOI|10.1158/1055-9965.EPI-10-1311}}. PMID 21750174.</ref> Teilweise können Erkenntnisse aus der molekularen Epidemiologie auch in eine Änderung von Handlungsanweisungen münden.<ref>P. A. Schulte, N. Rothman, P. Hainaut, M. T. Smith, P. Boffetta, F. P. Perera: ''Molecular epidemiology: linking molecular scale insights to population impacts.'' In: ''IARC scientific publications.'' Nummer 163, 2011, S.&nbsp;1–7, {{ISSN|0300-5038}}. PMID 22997853.</ref>
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Die molekulare Epidemiologie verwendet sequenzbasierte Daten oder andere Typisierungsdaten eines oder mehrerer [[Wikipedia:Biomarker (Medizin)|Biomarker]] zur Bestätigung oder zum Ausschluss von [[Wikipedia:Epidemie|Epidemie]]n,<ref name="PMID 24531166">R. Ranjbar, A. Karami, S. Farshad, G. M. Giammanco, C. Mammina: ''Typing methods used in the molecular epidemiology of microbial pathogens: a how-to guide.'' In: ''The new microbiologica.'' Band 37, Nummer 1, Januar 2014, S.&nbsp;1–15, {{ISSN|1121-7138}}. PMID 24531166.</ref> zur Ermittlung der [[Wikipedia:Infektkette|Transmission]] und der [[Wikipedia:Infektionsweg|Infektionsweg]]e, der Verbreitung, der [[Wikipedia:Replikation|Replikation]] und der [[Wikipedia:Mutation|Diversität]] von Pathogenen.<ref name="PMID 24631223">N. Field, T. Cohen, M. J. Struelens, D. Palm, B. Cookson, J. R. Glynn, V. Gallo, M. Ramsay, P. Sonnenberg, D. Maccannell, A. Charlett, M. Egger, J. Green, P. Vineis, I. Abubakar: ''Strengthening the Reporting of Molecular Epidemiology for Infectious Diseases (STROME-ID): an extension of the STROBE statement.'' In: ''[[Wikipedia:The Lancet Infectious Diseases|The Lancet Infectious Diseases]].'' Band 14, Nummer 4, April 2014, S.&nbsp;341–352, {{ISSN|1474-4457}}. {{DOI|10.1016/S1473-3099(13)70324-4}}. PMID 24631223.</ref> [[Wikipedia:Fehlerquelle|Fehlerquelle]]n der molekularen Epidemiologie sind z. B. eine unvollständige Datenerfassung.<ref>M. Desai, J. Kubo, D. Esserman, M. B. Terry: ''The handling of missing data in molecular epidemiology studies.'' In: ''[[Wikipedia:Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention|Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention]].'' Band 20, Nummer 8, August 2011, S.&nbsp;1571–1579, {{ISSN|1538-7755}}. {{DOI|10.1158/1055-9965.EPI-10-1311}}. PMID 21750174.</ref> Teilweise können Erkenntnisse aus der molekularen Epidemiologie auch in eine Änderung von Handlungsanweisungen münden.<ref>P. A. Schulte, N. Rothman, P. Hainaut, M. T. Smith, P. Boffetta, F. P. Perera: ''Molecular epidemiology: linking molecular scale insights to population impacts.'' In: ''IARC scientific publications.'' Nummer 163, 2011, S.&nbsp;1–7, {{ISSN|0300-5038}}. PMID 22997853.</ref>
    
Projekte zur Koordinierung von Erkenntnissen und Methoden sind z. B. STROBE und STROME-ID.<ref name="PMID 24631223" />
 
Projekte zur Koordinierung von Erkenntnissen und Methoden sind z. B. STROBE und STROME-ID.<ref name="PMID 24631223" />
    
== Methoden ==
 
== Methoden ==
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Neben der [[DNA-Sequenzierung]]<ref>J. A. Carriço, A. J. Sabat, A. W. Friedrich, M. Ramirez: ''Bioinformatics in bacterial molecular epidemiology and public health: databases, tools and the next-generation sequencing revolution.'' In: ''[[Eurosurveillance (Zeitschrift)|Eurosurveillance]].'' Band 18, Nummer 4, 2013, S.&nbsp;20382, {{ISSN|1560-7917}}. PMID 23369390.</ref><ref>M. Pérez-Losada, P. Cabezas, E. Castro-Nallar, K. A. Crandall: ''Pathogen typing in the genomics era: MLST and the future of molecular epidemiology.'' In: ''[[Infection, Genetics and Evolution]].'' Band 16, Juni 2013, S.&nbsp;38–53, {{ISSN|1567-7257}}. {{DOI|10.1016/j.meegid.2013.01.009}}. PMID 23357583.</ref> und anderen [[Genetischer Fingerabdruck|Genotypisierungsmethoden]]<ref>S. Baker, W. P. Hanage, K. E. Holt: ''Navigating the future of bacterial molecular epidemiology.'' In: ''Current Opinion in Microbiology.'' Band 13, Nummer 5, Oktober 2010, S.&nbsp;640–645, {{ISSN|1879-0364}}. {{DOI|10.1016/j.mib.2010.08.002}}. PMID 20846899. {{PMC|2963795}}.</ref> wird unter anderem auch die [[RNA-Seq]]<ref>C. M. McHale, L. Zhang, R. Thomas, M. T. Smith: ''Analysis of the transcriptome in molecular epidemiology studies.'' In: ''[[Environmental and Molecular Mutagenesis]].'' Band 54, Nummer 7, August 2013, S.&nbsp;500–517, {{ISSN|1098-2280}}. {{DOI|10.1002/em.21798}}. PMID 23907930.</ref> und die [[Proteinsequenzierung]] verwendet.<ref name="PMID 24531166" />
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Neben der [[Wikipedia:DNA-Sequenzierung|DNA-Sequenzierung]]<ref>J. A. Carriço, A. J. Sabat, A. W. Friedrich, M. Ramirez: ''Bioinformatics in bacterial molecular epidemiology and public health: databases, tools and the next-generation sequencing revolution.'' In: ''[[Wikipedia:Eurosurveillance (Zeitschrift)|Eurosurveillance]].'' Band 18, Nummer 4, 2013, S.&nbsp;20382, {{ISSN|1560-7917}}. PMID 23369390.</ref><ref>M. Pérez-Losada, P. Cabezas, E. Castro-Nallar, K. A. Crandall: ''Pathogen typing in the genomics era: MLST and the future of molecular epidemiology.'' In: ''[[Wikipedia:Infection, Genetics and Evolution|Infection, Genetics and Evolution]].'' Band 16, Juni 2013, S.&nbsp;38–53, {{ISSN|1567-7257}}. {{DOI|10.1016/j.meegid.2013.01.009}}. PMID 23357583.</ref> und anderen [[Wikipedia:Genetischer Fingerabdruck|Genotypisierungsmethoden]]<ref>S. Baker, W. P. Hanage, K. E. Holt: ''Navigating the future of bacterial molecular epidemiology.'' In: ''Current Opinion in Microbiology.'' Band 13, Nummer 5, Oktober 2010, S.&nbsp;640–645, {{ISSN|1879-0364}}. {{DOI|10.1016/j.mib.2010.08.002}}. PMID 20846899. {{PMC|2963795}}.</ref> wird unter anderem auch die [[Wikipedia:RNA-Seq|RNA-Seq]]<ref>C. M. McHale, L. Zhang, R. Thomas, M. T. Smith: ''Analysis of the transcriptome in molecular epidemiology studies.'' In: ''[[Wikipedia:Environmental and Molecular Mutagenesis|Environmental and Molecular Mutagenesis]].'' Band 54, Nummer 7, August 2013, S.&nbsp;500–517, {{ISSN|1098-2280}}. {{DOI|10.1002/em.21798}}. PMID 23907930.</ref> und die [[Wikipedia:Proteinsequenzierung|Proteinsequenzierung]] verwendet.<ref name="PMID 24531166" />
    
== Geschichte ==
 
== Geschichte ==
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Die Bezeichnung ‚molekulare Epidemiologie‘ wurde 1973 durch E. D. Kilbourne geprägt und 1993 präzisiert.<ref>E. D. Kilbourne: ''The molecular epidemiology of influenza.'' In: ''[[The Journal of Infectious Diseases]].'' Band 127, Nummer 4, April 1973, S.&nbsp;478–487, {{ISSN|0022-1899}}. PMID 4121053.</ref><ref>Schulte, Paul A.; Perera, Frederica P.: ''Molecular Epidemiology: Principles and Practice.'' Academic Press, 1993. ISBN 0-12-632346-1. S. 588.</ref>
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Die Bezeichnung ‚molekulare Epidemiologie‘ wurde 1973 durch E. D. Kilbourne geprägt und 1993 präzisiert.<ref>E. D. Kilbourne: ''The molecular epidemiology of influenza.'' In: ''[[Wikipedia:The Journal of Infectious Diseases|The Journal of Infectious Diseases]].'' Band 127, Nummer 4, April 1973, S.&nbsp;478–487, {{ISSN|0022-1899}}. PMID 4121053.</ref><ref>Schulte, Paul A.; Perera, Frederica P.: ''Molecular Epidemiology: Principles and Practice.'' Academic Press, 1993. ISBN 0-12-632346-1. S. 588.</ref>
    
== Siehe auch ==
 
== Siehe auch ==
Abgerufen von „https://de.imedwiki.org/wiki/Spezial:Mobiler_Unterschied/41033“
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